Department of Ophthalmology

2025

Convolutional Neural Networks for the segmentation of hippocampal structures in postmortem MRI scans

Anoop, B. N., Li, K., Honnorat, N., Rashid, T., Wang, D., Li, J., Fadaee, E., Charisis, S., Walker, J. M., Richardson, T. E., Wolk, D. A., Fox, P. T., Cavazos, J. E., Seshadri, S., Wisse, L. E. M. & Habes, M., mar 2025, En: Journal of Neuroscience Methods. 415, 110359.

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MRI free water mediates the association between diffusion tensor image analysis along the perivascular space and executive function in four independent middle to aged cohorts

for the MarkVCID Consortium, 2025, (Accepted/In press) En: Alzheimer's and Dementia.

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Acceso abierto

Multi-atlas multi-modality morphometry analysis of the South Texas Alzheimer's Disease Research Center postmortem repository

Honnorat, N., Mojtabai, M., Li, K., Li, J., Martinez, D. M., Rashid, T., Smith, M., Flanagan, M. E., Fadaee, E., Torres, M. F., Keating, M., Bieniek, K., Seshadri, S. & Habes, M., ene 2025, En: NeuroImage: Clinical. 45, 103752.

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Acceso abierto

Relation of MRI visible perivascular spaces with global and regional brain structural connectivity measures: The Framingham Heart Study (FHS)

Ekenze, O., Seiler, S., Pinheiro, A., DeCarli, C., Parva, P., Habes, M., Charidimou, A., Maillard, P., Beiser, A., Seshadri, S., Demissie, S. & Romero, J. R., jun 2025, En: Neurobiology of Aging. 150, p. 1-8 8 p.

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Sex and APOE ε4 allele differences in longitudinal white matter microstructure in multiple cohorts of aging and Alzheimer's disease

The Alzheimer's Disease Sequencing Project (ADSP), Alzheimer’S Disease Neuroimaging Initiative (Adni) & The BIOCARD Study Team, ene 2025, En: Alzheimer's and Dementia. 21, 1, e14343.

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Acceso abierto

Targeting cIAP2 in a novel senolytic strategy prevents glioblastoma recurrence after radiotherapy

Tomimatsu, N., Di Cristofaro, L. F. M., Kanji, S., Samentar, L., Jordan, B. R., Kittler, R., Habib, A. A., Espindola-Netto, J. M., Tchkonia, T., Kirkland, J. L., Burns, T. C., Sarkaria, J. N., Gilbert, A. R., Floyd, J. R., Hromas, R., Zhao, W., Zhou, D., Sung, P. M., Mukherjee, B. & Burma, S., 2025, (Accepted/In press) En: EMBO Molecular Medicine. 109441.

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Acceso abierto

Topical Caspofungin 0.5% Monotherapy for Filamentous Fungal Keratitis

Atighehchian, M., Ghassemi, H., Latifi, G., Ouano, D., Abedinifar, Z. & Zarei-Ghanavati, M., 2025, (Accepted/In press) En: Cornea. 10.1097/ICO.0000000000003790.

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2024

A Large Postmortem Database of COVID-19 Patients Can Inform Disease Research and Public Policy Decision Making

Hooper, J. E., Sanchez, H., Litovsky, S., Lu, Z. A., Gabrielson, E. W., Padera, R. F., Steffensen, T., Solomon, I. H., Gilbert, A., Threlkeld, K. J., Rapkiewicz, A. V., Harper, H., Kapp, M. E., Schwerdt, M. K., Mount, S., Wang, Y., Lu, R. & Williamson, A. K., nov 2024, En: Archives of Pathology and Laboratory Medicine. 148, 11, p. e386-e393

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Acceso abierto

Bilateral Combined Rhegmatogenous and Tractional Retinal Detachments Due to Persistent High-Titer Syphilis

Rahman, E. Z., Beck, K. D., Wong, R. W., Sohn, J. H., Diaz-Rohena, R. D. & Harper, C. A., ene 2024, En: Ophthalmic Surgery Lasers and Imaging Retina. 55, 1, p. 46-50 5 p.

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Brain aging patterns in a large and diverse cohort of 49,482 individuals

Yang, Z., Wen, J., Erus, G., Govindarajan, S. T., Melhem, R., Mamourian, E., Cui, Y., Srinivasan, D., Abdulkadir, A., Parmpi, P., Wittfeld, K., Grabe, H. J., Bülow, R., Frenzel, S., Tosun, D., Bilgel, M., An, Y., Yi, D., Marcus, D. S. & LaMontagne, P. y 33 otros, Benzinger, T. L. S., Heckbert, S. R., Austin, T. R., Waldstein, S. R., Evans, M. K., Zonderman, A. B., Launer, L. J., Sotiras, A., Espeland, M. A., Masters, C. L., Maruff, P., Fripp, J., Toga, A. W., O’Bryant, S., Chakravarty, M. M., Villeneuve, S., Johnson, S. C., Morris, J. C., Albert, M. S., Yaffe, K., Völzke, H., Ferrucci, L., Nick Bryan, R., Shinohara, R. T., Fan, Y., Habes, M., Lalousis, P. A., Koutsouleris, N., Wolk, D. A., Resnick, S. M., Shou, H., Nasrallah, I. M. & Davatzikos, C., oct 2024, En: Nature Medicine. 30, 10, p. 3015-3026 12 p.

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9 Citas (Scopus)

Comparison of corneal tomographic parameters between Hispanic and non-Hispanic patients

Uhm, S. Y., Do, T. P., Montoya, R. H., Lam, B. & Kheirkhah, A., ene 2024, En: Graefe's Archive for Clinical and Experimental Ophthalmology. 262, 1, p. 143-148 6 p.

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1 Cita (Scopus)

Cross-Vendor Test-Retest Validation of Diffusion Tensor Image Analysis along the Perivascular Space (DTI-ALPS) for Evaluating Glymphatic System Function

the MarkVCID Consortium, ago 1 2024, En: Aging and Disease. 15, 4, p. 1885-1898 14 p.

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Acceso abierto

18 Citas (Scopus)

Depth, size of infiltrate, and the microbe – The trio that prognosticates the outcome of infective keratitis

Sankara Nethralaya Cornea Emergency Team (SNCET), ene 2024, En: Indian Journal of Ophthalmology. 72, 1, p. 44-52 9 p.

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Acceso abierto

4 Citas (Scopus)

Gene-SGAN: discovering disease subtypes with imaging and genetic signatures via multi-view weakly-supervised deep clustering

Yang, Z., Wen, J., Abdulkadir, A., Cui, Y., Erus, G., Mamourian, E., Melhem, R., Srinivasan, D., Govindarajan, S. T., Chen, J., Habes, M., Masters, C. L., Maruff, P., Fripp, J., Ferrucci, L., Albert, M. S., Johnson, S. C., Morris, J. C., LaMontagne, P. & Marcus, D. S. y 8 otros, Benzinger, T. L. S., Wolk, D. A., Shen, L., Bao, J., Resnick, S. M., Shou, H., Nasrallah, I. M. & Davatzikos, C., dic 2024, En: Nature communications. 15, 1, 354.

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Acceso abierto

13 Citas (Scopus)

Genetic and clinical correlates of two neuroanatomical AI dimensions in the Alzheimer’s disease continuum

Wen, J., Yang, Z., Nasrallah, I. M., Cui, Y., Erus, G., Srinivasan, D., Abdulkadir, A., Mamourian, E., Hwang, G., Singh, A., Bergman, M., Bao, J., Varol, E., Zhou, Z., Boquet-Pujadas, A., Chen, J., Toga, A. W., Saykin, A. J., Hohman, T. J. & Thompson, P. M. y 30 otros, Villeneuve, S., Gollub, R., Sotiras, A., Wittfeld, K., Grabe, H. J., Tosun, D., Bilgel, M., An, Y., Marcus, D. S., LaMontagne, P., Benzinger, T. L., Heckbert, S. R., Austin, T. R., Launer, L. J., Espeland, M., Masters, C. L., Maruff, P., Fripp, J., Johnson, S. C., Morris, J. C., Albert, M. S., Bryan, R. N., Resnick, S. M., Ferrucci, L., Fan, Y., Habes, M., Wolk, D., Shen, L., Shou, H. & Davatzikos, C., dic 2024, En: Translational psychiatry. 14, 1, 420.

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Acceso abierto

1 Cita (Scopus)

Heart rate fragmentation and brain MRI markers of small vessel disease in MESA

Heckbert, S. R., Jensen, P. N., Erus, G., Nasrallah, I. M., Rashid, T., Habes, M., Austin, T. R., Floyd, J. S., Schaich, C. L., Redline, S., Bryan, R. N. & Costa, M. D., feb 2024, En: Alzheimer's and Dementia. 20, 2, p. 1397-1405 9 p.

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Acceso abierto

Plasma Biomarkers of Brain Injury and Their Association With Brain MRI and Cognition in Type 1 Diabetes

for the DCCT/EDIC Research Group, sept 2024, En: Diabetes care. 47, 9, p. 1530-1538 9 p.

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Acceso abierto

4 Citas (Scopus)

Protocol for hybrid structured-light three-dimensional scanning and modeling of human postmortem brains

Smith, M. M., Ochoa, E., Barannikov, S., Keating, M., Habes, M., Flanagan, M. E., Seshadri, S. & Bieniek, K. F., sept 20 2024, En: STAR Protocols. 5, 3, 103246.

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Acceso abierto

Relationship between MRI brain-age heterogeneity, cognition, genetics and Alzheimer's disease neuropathology

Antoniades, M., Srinivasan, D., Wen, J., Erus, G., Abdulkadir, A., Mamourian, E., Melhem, R., Hwang, G., Cui, Y., Govindarajan, S. T., Chen, A. A., Zhou, Z., Yang, Z., Chen, J., Pomponio, R., Sotardi, S., An, Y., Bilgel, M., LaMontagne, P. & Singh, A. y 16 otros, Benzinger, T., Beason-Held, L., Marcus, D. S., Yaffe, K., Launer, L., Morris, J. C., Tosun, D., Ferrucci, L., Bryan, R. N., Resnick, S. M., Habes, M., Wolk, D., Fan, Y., Nasrallah, I. M., Shou, H. & Davatzikos, C., nov 2024, En: EBioMedicine. 109, 105399.

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Acceso abierto

1 Cita (Scopus)

Riemannian frameworks for the harmonization of resting-state functional MRI scans

Honnorat, N., Seshadri, S., Killiany, R., Blangero, J., Glahn, D. C., Fox, P. & Habes, M., ene 2024, En: Medical Image Analysis. 91, 103043.

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Acceso abierto

Sacituzumab Govitecan in patients with breast cancer brain metastases and recurrent glioblastoma: a phase 0 window-of-opportunity trial

Balinda, H. U., Kelly, W. J., Kaklamani, V. G., Lathrop, K. I., Canola, M. M., Ghamasaee, P., Sareddy, G. R., Michalek, J., Gilbert, A. R., Surapaneni, P., Tiziani, S., Pandey, R., Chiou, J., Lodi, A., Floyd, J. R. & Brenner, A. J., dic 2024, En: Nature communications. 15, 1, 6707.

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Acceso abierto

9 Citas (Scopus)

Sexually transmitted infections and HIV in ophthalmology

Bibb, L. A., Htet, K. Z., Waldman, C. W. & Sloan, S. B., ene 1 2024, En: Clinics in Dermatology. 42, 1, p. 25-37 13 p.

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1 Cita (Scopus)

The Association of Upper Airway Anatomy with Brain Structure: The Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis

Nance, R. M., Fohner, A. E., McClelland, R. L., Redline, S., Nick Bryan, R., Desiderio, L., Habes, M., Longstreth,, W. T., Schwab, R. J., Wiemken, A. S. & Heckbert, S. R., jun 2024, En: Brain Imaging and Behavior. 18, 3, p. 510-518 9 p.

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The Infectious Uveitis Treatment Algorithm Network (TITAN) Report 1—global current practice patterns for the management of Herpes Simplex Virus and Varicella Zoster Virus anterior uveitis

on behalf of TITAN consensus guidelines group, ene 2024, En: Eye (Basingstoke). 38, 1, p. 61-67 7 p.

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Acceso abierto

2 Citas (Scopus)

The Infectious Uveitis Treatment Algorithm Network (TITAN) Report 2—global current practice patterns for the management of Cytomegalovirus anterior uveitis

on behalf of TITAN consensus guidelines group, ene 2024, En: Eye (Basingstoke). 38, 1, p. 68-75 8 p.

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5 Citas (Scopus)

The posterior auricular muscle complex graft as a porous orbital implant wrap: long-term follow-up over a 31-year period

Naugle, T. C., Thompson, J. P., Ford, J. R., Acosta, K. V., Caplan, C. M., Callahan, M. A., Pharo, A. M., Laplant, J. F., Azar, S. E. & Fry, C. L., 2024, En: Orbit. 43, 3, p. 283-289 7 p.

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Trajectories in depressive symptoms and midlife brain health

Dintica, C. S., Habes, M., Schreiner, P. J., Launer, L. J. & Yaffe, K., dic 2024, En: Translational psychiatry. 14, 1, 169.

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Acceso abierto

Updates on Pediatric Glaucoma: Medical and Surgical Interventions

Garcia, J., Madaik, H., Lind, T. & Nguyen, L., dic 2024, En: Current Ophthalmology Reports. 12, 4, p. 49-54 6 p.

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Urinary Metal Levels, Cognitive Test Performance, and Dementia in the Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis

Domingo-Relloso, A., McGraw, K. E., Heckbert, S. R., Luchsinger, J. A., Schilling, K., Glabonjat, R. A., Martinez-Morata, I., Mayer, M., Liu, Y., Wood, A. C., Goldsmith, J., Hayden, K. M., Habes, M., Nasrallah, I. M., Bryan, R. N., Rashid, T., Post, W. S., Rotter, J. I., Palta, P. & Valeri, L. y 2 otros, Hughes, T. M. & Navas-Acien, A., dic 2024, En: JAMA network open. 7, 12, e2448286.

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2023

ADCoC: Adaptive Distribution Modeling Based Collaborative Clustering for Disentangling Disease Heterogeneity from Neuroimaging Data

Liu, H., Grothe, M. J., Rashid, T., Labrador-Espinosa, M. A., Toledo, J. B. & Habes, M., abr 1 2023, En: IEEE Transactions on Emerging Topics in Computational Intelligence. 7, 2, p. 308-318 11 p.

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Acceso abierto

4 Citas (Scopus)

Alzheimer's Disease Genetic Risk, Cognition, and Brain Aging in Midlife

Brenowitz, W. D., Fornage, M., Launer, L. J., Habes, M., Davatzikos, C. & Yaffe, K., mar 2023, En: Annals of neurology. 93, 3, p. 629-634 6 p.

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Acceso abierto

3 Citas (Scopus)

Assessment of Risk Factors and Clinical Importance of Enlarged Perivascular Spaces by Whole-Brain Investigation in the Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis

Charisis, S., Rashid, T., Liu, H., Ware, J. B., Jensen, P. N., Austin, T. R., Li, K., Fadaee, E., Hilal, S., Chen, C., Hughes, T. M., Romero, J. R., Toledo, J. B., Longstreth, W. T., Hohman, T. J., Nasrallah, I., Bryan, R. N., Launer, L. J., Davatzikos, C. & Seshadri, S. y 2 otros, Heckbert, S. R. & Habes, M., abr 2023, En: JAMA network open. 6, 4, e239196.

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Acceso abierto

5 Citas (Scopus)

Association of brain microbleeds with risk factors, cognition, and MRI markers in MESA

Jensen, P. N., Rashid, T., Ware, J. B., Cui, Y., Sitlani, C. M., Austin, T. R., Longstreth, W. T., Bertoni, A. G., Mamourian, E., Bryan, R. N., Nasrallah, I. M., Habes, M. & Heckbert, S. R., sept 2023, En: Alzheimer's and Dementia. 19, 9, p. 4139-4149 11 p.

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5 Citas (Scopus)

Association of Intensive vs Standard Blood Pressure Control with Regional Changes in Cerebral Small Vessel Disease Biomarkers: Post Hoc Secondary Analysis of the SPRINT MIND Randomized Clinical Trial

Rashid, T., Li, K., Toledo, J. B., Nasrallah, I., Pajewski, N. M., Dolui, S., Detre, J., Wolk, D. A., Liu, H., Heckbert, S. R., Bryan, R. N., Williamson, J., Davatzikos, C., Seshadri, S., Launer, L. J. & Habes, M., mar 1 2023, En: JAMA network open. 6, 3, p. E231055

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Acceso abierto

18 Citas (Scopus)

Association of spermidine plasma levels with brain aging in a population-based study

Wortha, S. M., Frenzel, S., Bahls, M., Habes, M., Wittfeld, K., Van der Auwera, S., Bülow, R., Zylla, S., Friedrich, N., Nauck, M., Völzke, H., Grabe, H. J., Schwarz, C. & Flöel, A., may 2023, En: Alzheimer's and Dementia. 19, 5, p. 1832-1840 9 p.

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Acceso abierto

11 Citas (Scopus)

Comparison of netarsudil and latanoprostene bunod as adjuncts to maximum medical therapy in primary open-angle glaucoma

Bahr, T., Woolf, S., Favre, H. & Waldman, C., ago 2023, En: Canadian Journal of Ophthalmology. 58, 4, p. 356-360 5 p.

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1 Cita (Scopus)

Deep learning based detection of enlarged perivascular spaces on brain MRI

Rashid, T., Liu, H., Ware, J. B., Li, K., Romero, J. R., Fadaee, E., Nasrallah, I. M., Hilal, S., Bryan, R. N., Hughes, T. M., Davatzikos, C., Launer, L., Seshadri, S., Heckbert, S. R. & Habes, M., mar 2023, En: Neuroimage: Reports. 3, 1, 100162.

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Acceso abierto

15 Citas (Scopus)

Determinants of Perivascular Spaces in the General Population: A Pooled Cohort Analysis of Individual Participant Data

Evans, T. E., Knol, M. J., Schwingenschuh, P., Wittfeld, K., Hilal, S., Ikram, M. A., Dubost, F., Van Wijnen, K. M. H., Katschnig, P., Yilmaz, P., De Bruijne, M., Habes, M., Chen, C., Langer, S., Völzke, H., Ikram, M. K., Grabe, H. J., Schmidt, R., Adams, H. H. H. & Vernooij, M. W., ene 10 2023, En: Neurology. 100, 2, p. E107-E122

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Acceso abierto

28 Citas (Scopus)

Diagnostic and Therapeutic Challenges

Handa, S., Sen, A., More, A., Arora, A., Sharma, A., Gupta, A., Gupta, V., Agarwal, M. & Agarwal, A., ago 1 2023, En: Retina. 43, 8, p. 1420-1424 5 p.

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Diagnostic and Therapeutic Challenges

Arora, A., Dogra, M., Sharma, A., Singh, S. R., Agrawal, R., Neri, P., Gupta, V. & Agarwal, M., may 1 2023, En: Retina. 43, 5, p. 864-869 6 p.

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Elevated blood pressure is associated with advanced brain aging in mid-life: A 30-year follow-up of The CARDIA Study

Dintica, C. S., Habes, M., Erus, G., Vittinghoff, E., Davatzikos, C., Nasrallah, I. M., Launer, L. J., Sidney, S. & Yaffe, K., mar 2023, En: Alzheimer's and Dementia. 19, 3, p. 924-932 9 p.

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Acceso abierto

5 Citas (Scopus)

ELF4 is a critical component of a miRNA-transcription factor network and is a bridge regulator of glioblastoma receptor signaling and lipid dynamics

Kosti, A., Chiou, J., Guardia, G. D. A., Lei, X., Balinda, H., Landry, T., Lu, X., Qiao, M., Gilbert, A., Brenner, A., Galante, P. A. F., Tiziani, S. & Penalva, L. O. F., mar 1 2023, En: Neuro-oncology. 25, 3, p. 459-470 12 p.

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Acceso abierto

11 Citas (Scopus)

Genomic loci influence patterns of structural covariance in the human brain

Wen, J., Nasrallah, I. M., Abdulkadir, A., Satterthwaite, T. D., Yang, Z., Erus, G., Timothy, R. F., Singh, A., Sotiras, A., Boquet-Pujada, A., Mamourian, E., Doshi, J., Cui, Y., Srinivasan, D., Skampardoni, I., Chen, J., Hwang, G., Bergman, M., Bao, J. & Veturi, Y. y 46 otros, Zhou, Z., Yang, S., Dazzan, P., Kahn, R. S., Schnack, H. G., Zanetti, M. V., Meisenzahl, E., Busatto, G. F., Crespo-Facorr, B., Pantelis, C., Wood, S. J., Zhuo, C., Shinohara, R. T., Gur, R. C., Gur, R. E., Koutsouleris, N., Wolf, D. H., Saykin, A. J., Ritchie, M. D., Shen, L., Thompson, P. M., Colliot, O., Wittfeld, K., Grabe, H. J., Tosun, D., Bilgel, M., An, Y., Marcus, D. S., LaMontagne, P., Heckbert, S. R., Austin, T. R., Launer, L. J., Espeland, M., Masters, C. L., Maruff, P., Fripp, J., Johnson, S. C., Morris, J. C., Albert, M. S., Bryan, R. N., Resnick, S. M., Fan, Y., Habes, M., Wolk, D., Shou, H. & Davatzikos, C., 2023, En: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 120, 52, e2300842120.

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Acceso abierto

8 Citas (Scopus)

Higher performance for women than men in MRI-based Alzheimer’s disease detection

for the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative, dic 2023, En: Alzheimer's Research and Therapy. 15, 1, 84.

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11 Citas (Scopus)

Implementation of entrustable professional activities in multiple surgical residencies: A quality improvement approach

Dent, D. L., Patnaik, R., Atkinson, A., Shomette, J. D., Mascitelli, J. R., Page-Ramsey, S. M., Basler, J. W., Carpenter, A. J., Kempenich, J. W., Rose, R. A., Anderson, K. L., Botros-Brey, S. & Jones, W. S., dic 2023, En: American journal of surgery. 226, 6, p. 868-872 5 p.

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5 Citas (Scopus)

Long-term depressive symptoms and midlife brain age

Dintica, C. S., Habes, M., Erus, G., Simone, T., Schreiner, P. & Yaffe, K., ene 1 2023, En: Journal of Affective Disorders. 320, p. 436-441 6 p.

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5 Citas (Scopus)

Lysine-specific histone demethylase 1A (KDM1A/LSD1) inhibition attenuates DNA double-strand break repair and augments the efficacy of temozolomide in glioblastoma

Alejo, S., Palacios, B. E., Venkata, P. P., He, Y., Li, W., Johnson, J. D., Chen, Y., Jayamohan, S., Pratap, U. P., Clarke, K., Zou, Y., Lv, Y., Weldon, K., Viswanadhapalli, S., Lai, Z., Ye, Z., Chen, Y., Gilbert, A. R., Suzuki, T. & Tekmal, R. R. y 5 otros, Zhao, W., Zheng, S., Vadlamudi, R. K., Brenner, A. J. & Sareddy, G. R., jul 1 2023, En: Neuro-oncology. 25, 7, p. 1249-1261 13 p.

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12 Citas (Scopus)

Patterns of Regional Brain Atrophy and Brain Aging in Middle- and Older-Aged Adults With Type 1 Diabetes

DCCT/EDIC Research Group, jun 1 2023, En: JAMA network open. 6, 6, p. E2316182

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Acceso abierto

14 Citas (Scopus)

Postmortem Brain Imaging in Alzheimer’s Disease and Related Dementias: The South Texas Alzheimer’s Disease Research Center Repository

Li, K., Rashid, T., Li, J., Honnorat, N., Nirmala, A. B., Fadaee, E., Wang, D., Charisis, S., Liu, H., Franklin, C., Maybrier, M., Katragadda, H., Abazid, L., Ganapathy, V., Valaparla, V. L., Bagudu, P., Vasquez, E., Solano, L., Clarke, G. & Maestre, G. y 6 otros, Richardson, T., Walker, J., Fox, P. T., Bieniek, K., Seshadri, S. & Habes, M., nov 21 2023, En: Journal of Alzheimer's Disease. 96, 3, p. 1267-1283 17 p.

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Acceso abierto

7 Citas (Scopus)

Proliferative Diabetic Retinopathy Requiring Vitrectomy Over Clinic Management During COVID-19: Impact of Delayed Care

Ahearn, B. E., Nguyen, H. & Sohn, J. H., ago 2023, En: Korean journal of ophthalmology : KJO. 37, 4, p. 292-298 7 p.

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1 Cita (Scopus)

Department of Ophthalmology

Producción científica

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